https://virgool.ir/feed/@ssarrayاولین مجموعه تخصصی شیمی و دارو در کشورfa2026-11-12 05:42:55https://files.virgool.ir/upload/users/1311840/avatar/mkZo0Q.pnghttps://virgool.ir/@ssarrayhttps://virgool.ir/@ssarray/طراحی-دارو-کامپیوتری-ralssbsjbztnطراحی دارو کامپیوتریطراحی داورهای جدید با استفاده از شبیه سازی رایانه ای و با کمک نرم افزارهای طراحی دارو ، می تواند موجب تحولی در صنعت داروسازی و نیز مبارزه موثرتر با برخی بیماری ها شود.طراحی یک داروی جدید بسیار پرهزینه و زمان بر است و به صورت معمول برای طراحی یک دارو به حدود 2 میلیارد دلار هزینه و نیز 10 الی 15 سال زمان برای طراحی، آزمایش و عرضه دارو به بازار نیاز است.به صورت معمول، مولکول های داروها با پروتئین های عامل بیماری واکنش می دهند. یافتن مولکول هایی مناسب که بتوانند با کمترین اثرات جانبی با این پروتئین ها مبارزه کنند، نیازمند تولید تعداد بسیار زیادی ترکیبات شیمیایی مختلف در آزمایشگاه و آزمایش تک تک آنها است.در روش طراحی دارو کامپیوتری به جای اینکه چندین روز و حتی هفته زمان برای واکنش میان مولکول های دارو و مولکول های هدف صرف شود، تمام مراحل این واکنش در مدت چند ثانیه در رایانه شبیه سازی می شود. در واقع به این ترتیب می توان مولکولهایی که دارای بیشترین تاثیر و نیز کمترین عوارض جانبی هستند را از میان انبوهی از ترکیبات مولکولی ممکن بازشناختالبته باید فرآیندی طولانی برای اطمینان از اثربخشی دارو طی شود و در مرحله بعد، واکنش مولکولهای منتخب در آزمایشگاه تکرار می شود تا به طور کامل از اثربخشی آن اطمینان حاصل شود. به این ترتیب شبیه سازی رایانه ای موجب صرفه جویی قابل توجهی در زمان و نیز هزینه های مراحل نخست کار طراحی دارو خواهد شد.اطلاعات بیشتر درباره طراحی داروموسسه سارایموسسه سارایMon, 15 Nov 2021 12:32:59 +0330https://virgool.ir/@ssarray/ساراناز-مقیمی-مدیر-موسسه-سارای-اولین-مجموعه-شیمی-و-دارو-در-کشور-bdxdaplviutvدکتر ساراناز مقیمیموسسه سارای با مدیریت ساراناز مقیمی ، جامع ترین موسسه برگزار کننده دوره های مهارتی - آموزشی در زمینه های شیمی و دارویی و کارگاه های تخصصی و کاربردی در جهت توانمندسازی و ارتقا رزومه دانشجویان و فارغ التحصیلان رشته های شیمی و دارو و همچنین انجام پروژه های تحقیقاتی میباشد.دپارتمان تخصصی شیمی و دارو سارای اولین و برترین مجموعه ارائه دهنده ی خدمات به علاقه مندان حیطه شیمی و دارو در کشور میباشد.مجموعه سارای اولین مرجع شیمی و دارو در کشور با هدف تامین نیروی متخصص و کارآمد؛ برگزار کننده دوره های مهارتی-آموزشی و تامین کارآموز، هنر جو و نیروی انسانی جهت ورود به بازار کار برای صنایع شیمی و دارویی کشور است.ارتباط با موسسه سارایاینستاگرام دکتر ساراناز مقیمیموسسه سارایموسسه سارایSat, 13 Nov 2021 11:16:13 +0330https://virgool.ir/@ssarray/نرم-افزارهای-طراحی-دارو-ank29nk6qdrxامروزه با توجه به پیشرفت تکنولوژی و استفاده از روش های نوین و با توجه به مقرون به صرفه و سریع تر بودن ، طراحی دارو با کمک نرم افزارهای کامپیوتری و غربالگری مجازی انجام میشود.در این روش برای طراحی مولکول های دارویی به روش مجازی از نرم افزارها و دیتابانک های مختلفی استفاده میشود:پروتئین دیتا بانک PDBwww.rcsb.orgارائه اطلاعات جامع درباره ترکیبات بیولوژیک و ماکرومولکول هاساختار پروتئین ها و نوکلئیک اسیدهاPubchemPubChem (nih.gov)نرم افزار ترکیبات شیمیایینرم افزارهای داکینگMolegro Virtual Docker (MVD)AutoDockGoldنرم افزارهای آنالیز پارامترهای فارماکوکینتیکیADMETآشنایی بیشتر با طراحی دارو کامپیوتریطراحی دارو کامپیوتریموسسه سارایموسسه سارایTue, 09 Nov 2021 20:49:40 +0330https://virgool.ir/@ssarray/موسسه-سارای-sgm9rgd5ezb0موسسه سارایموسسه سارای با مدیریت ساراناز مقیمی ، جامع ترین موسسه برگزار کننده دوره های مهارتی - آموزشی در زمینه های شیمی و دارویی و کارگاه های تخصصی و کاربردی در جهت توانمندسازی و ارتقا رزومه دانشجویان و فارغ التحصیلان رشته های شیمی و دارو و همچنین انجام پروژه های تحقیقاتی میباشد.دپارتمان تخصصی شیمی و دارو سارای اولین و برترین مجموعه ارائه دهنده ی خدمات به علاقه مندان حیطه شیمی و دارو در کشور میباشد.مجموعه سارای اولین مرجع شیمی و دارو در کشور با هدف تامین نیروی متخصص و کارآمد؛ برگزار کننده دوره های مهارتی-آموزشی و تامین کارآموز، هنر جو و نیروی انسانی جهت ورود به بازار کار برای صنایع شیمی و دارویی کشور است.موسسه سارای با به کارگیری متدهای جدید در بحث آموزش و کسب مهارت، قادر به ارائه ی خدماتی منحصر به فرد می‌باشد و تمامی خواسته های شما عزیزان را با توجه و درایت پاسخگوست.شک نکنید موفقیت از آن شماستبا ما همراه شویدوبسایت موسسه سارایهمراه با موسسه سارایموسسه سارایموسسه سارایSun, 07 Nov 2021 19:48:34 +0330https://virgool.ir/@ssarray/drug-design-utamb6ye9scgطراحی دارو به کمک نرم افزارهای کامپیوتریطراحی دارو چیست ؟طراحی مولکول های دارویی برمبنای یک هدف زیستیِ مشخص با استفاده از نرم افزارهای کامپیوتری را طراحی دارو میگویند.دارو چیست ؟دارو معمولاً یک مولکول آلی است که کارکرد یک زیست‌مولکول را  تغییر می‌دهد.هدف دارو ،زیست‌مولکولی است که در مسیر‌های سوخت‌وساز و پیام‌رسانی مختص به فرآیند یک بیماری خاص نقش دارد. زیست‌مولکول‌ها با ارتباط با یکدیگر به واسطه‌ی تعامل پروتئین-پروتئین و یا پروتئین-اسید نوکلئیک که به انتقال پیام‌ها یا تغییرات متابولیکی منجر می‌شود، نقش مهمی در پیشرفت بیماری ایفا می‌کنند، بنابراین تنظیم عملکرد این زیست‌مولکول‌ها می‌تواند برای جلوگیری از پیشرفت بیماری و یا درمان سودمند باشد.برای تنظیم عملکرد زیست‌مولکول‌ها سه راه وجود دارد:۱. مهار عملکرد زیست‌مولکول‌ها با استفاده از مولکول‌های کوچک که با اتصال به آن‌ها مانع از اتصال لیگاند‌ها به آن‌ها می‌شوند (بلاک شدن)۲. محدود کردن تعامل میان زیست‌مولکول‌ها با استفاده از مولکول‌های کوچک۳. فعال کردن زیست‌مولکول‌هایی که عملکرد آن‌ها در برخی بیماری‌ها مانندسرطان مختل شده است.طراحی دارو با استفاده از کامپیوترکشف داروی جدید و بهبود عملکرد داروها نیازمند صرف زمان و هزینه‌ی بسیاری است که با استفاده از کامپیوتر و نرم افزار های کامپیوتری ودیتابانک های موجود (علم بیوانفورماتیک) میتوان به میزان چشم‌گیری کاهش داد.از طراحی دارو می‌توان در موارد زیر استفاده کرد:غربالگری مجازی با استفاده از روش‌های لیگاندبنیان و ساختاربنیانپیش‌بینی و تخمین تمایل اتصال ترکیبات مختلف به هدف و امتیاز‌دهی به ترکیبات مختلف بر اساس آنبهینه‌سازی تمایل اتصال و انتخاب در ترکیبات پیش‌روطراحی مولکول های جدید از طریق اتصال قطعات ترکیبات مختلف و یا رشد یک مولکول اولیهساخت مجموعه داده‌ها و توسعه دیتابیس ها در جهت استفاده در طراحی دارودر حال حاضر طراحی دارو به کمک کامپیوتر  به عنوان یکی از ابزارهای بسیار مفید برای توسعه منطقی داروها، مورد توجه قرار گرفته است که در واقع شامل طراحی دارو از روی ساختار بوده و توانسته زمان لازم برای شناسایی و طراحی ترکیبات دارویی، نوع آن ها و بهینه سازی ساختارشان را به حداقل زمان برساند. این روش در طی 20 سال توسعه و تکامل پیدا کرده و به یکی از شاخه های علمی مهم در شیمی دارویی و علوم زیستی تبدیل شده است.نرم افزارهای طراحی دارو چیست؟روش های طراحی داروداروپردازی با کامپیوتر را می توان به سه دسته متفاوت تقسیم کرد :روش مبتنی برگیرنده ( Dock Receptor Based Approach )هنگامی که ساختار سه بعدی مولکول های لیگاند و گیرنده (رسپتور) آن معلوم است روش مبتنی بر گیرنده، کاندید خوبی برای شناسایی و یا بهینه کردن داروهاست. به خاطر حضور ساختارهای سه بعدی ترکیبات و گیرنده، ماهیت برهمکنش بین لیگاند و گیرنده و از طرفی نوع ساختاری که لیگاند می تواند داشته باشد تا بر همکنش بین آن ها در شرایط مطلوبی قرار بگیرد را می توان با استفاده از این روش تشخیص داد.ترکیب بر روی جایگاه فعال داک شده ( در اصطلاح به معنی لنگر اندازی است) و بر همکنش لیگاند با رسپتور بوسیله مکانیک مولکولی و دینامیک مولکولی شبیه سازی می شود.در این روش بر اثر داک شدن لیگاند در جایگاه فعال، لیگاند از لحاظ کنفورماسیونی تغییر پیدا می کند و در شرایط مختلف وضعیتش عوض می شود و در انواع حالات مختلف با گیرنده برهمکنش نشان می دهد. برای تعیین نوع لیگاندهایی که می توانند به جایگاه گیرنده داک شوند(داکینگ مولکولی لیگاند و رسپتور)، تطابق شکل و نیز مکمل بودن قسمت های آب گریز، آب دوست و باردار در هر دو باید در نظر گرفته شوند.روش مبتنی بر لیگاند (Ligand Based Approach)در این روش تمرکز بر روی لیگاند میباشد زیرا که ساختارهای سه بعدی گیرنده (رسپتور) مشخص نیست و در عوض ساختار لیگاندها معلوم است از این روش استفاده می شود که از جمله روشهای مرسوم در طراحی دارو می باشد. در این روش بطور غیر مستقیم با مطالعه ترکیباتی که با مولکول های زیستی واکنش نشان می دهند به دنبال طراحی ترکیباتی هستند که از لحاظ فارماکولوژیکی فعال باشند.در روشهای طراحی دارو مبتنی بر لیگاند در فقدان ساختار مولکول های زیستی با مطالعه لیگاند های مشخص به دنبال شناخت ویژگی های ساختاری وفیزیکوشیمیایی ترکیبات بوده تا بتوان ترکیب مورد نظر را بر اساس داده هایی که از مطالعه ترکیبات قبلی استخراج می شود، طراحی نمود.این روش به نوعی طراحی دارو بر اساس فارماکوفور است (فارماکوفور به قسمتی از دارو اطلاق می شود که اثر دارو وابسته به آن بخش از مولکول است) و بوسیله مطالعه روابط کمی ساختار با فعالیت آن ها می توان داروها را بوسیله این روش طراحی نمود، بطوری که می توان گفت روشی برای طراحی فارماکوفور داروهاست.رویکرد مبتنی بر طراحی De Novo( De Novo Design Based Approach )زمانی که ساختار لیگاند مشخص نیست اما ساختار گیرنده معلوم باشد از این روش استفاده می شود. در این روش اطلاعاتی از ساختارهای گیرنده یا شبه گیرنده ها وجود دارد اما ساختار ترکیب اصلی که بتواند با جایگاه فعال گیرنده بر همکنش داشته باشد وجود ندارد.یکی از عملکردهای طراحی دارو بر پایه این روش پیشنهاد و ارائه ترکیب اصلی است که با جایگاه فعال مکمل باشد. اساس روش به این صورت است که از پایگاه دادۀ ساختارهای سه بعدی موجود، برای پیدا کردن مولکول های کوچکی که بتوانند با جایگاه فعال گیرنده از لحاظ اندازه، ژئومتری و گروه های عاملی میانکنش مناسبی داشته باشند استفاده می شود.روش ساختاربنیانداروپردازی مستقیم روشی است که طی آن با درنظرگرفتن ساختار سه‌بعدی هدف زیستی، که معمولاً با کمک طیف‌بینی رزونانس مغناطیسی هسته‌ای یا بلورشناسی پرتو ایکس تعیین می‌گردد، به طراحی دارو پرداخته می‌شود.فرآیند داروپردازی ساختاربنیان شامل چندین چرخه‌ی مکرر پیش از رسیدن به مرحله‌ی کارآزمایی بالینی است. اولین چرخه شامل شبیه‌سازی، خالص‌سازی و تعیین ساختار هدف زیستی به کمک بلورشناسی پرتو ایکس، طیف‌بینی رزونانس مغناطیسی هسته‌ای و یا مدل‌سازی هومولوژی می‌باشد.اغلب پس از آن با استفاده از الگوریتم‌های کامپیوتری، ترکیباتی از یک پایگاه داده در یک محیط شبیه‌سازی شده در یک ناحیه‌ی مشخص از ساختار هدف قرار گرفته و بر اساس فعل و انفعالات الکترواستاتیک و موقعیت فضایی نسبت به هدف، امتیازدهی شده و بهترین آن‌ها انتخاب می‌شوند. در چرخه‌ی دوم موقعیت‌هایی از این ترکیبات که قابلیت بهینه شدن برای ارتقای توانایی دارو را دارند مشخص می‌شوند.درچرخه‌های بعدی فرآیند بهینه‌سازی ترکیبات و پیدا کردن هدف‌های جدید به طور مکرر انجام می‌شود تا سرانجام ترکیبات بهینه و موثر روی هدف دارو پیدا شوند.روش لیگاند بنیانروش لیگاند بنیان یا داروپردازی غیرمستقیم، روشی است که طی آن با درنظرگرفتن مولکول‌هایی که تمایل به برقراری پیوند با هدف زیستی دارند، به طراحی دارو پرداخته می‌شود.با استفاده از این مولکول‌ها یک مدل داروبر به دست می‌آید که حداقل ویژگی‌های ساختاری را که یک مولکول برای اتصال به هدف نیاز دارد تعیین می‌کند. به عبارت دیگر با استفاده از دانش کسب شده در مورد مولکول‌هایی که به هدف اتصال پیدا می‌کنند، می‌توان مدلی از هدف ارايه داد. از این مدل جدید می‌توان برای طراحی عناصر مولکولی جدید که با هدف تعامل دارند استفاده نمود.Golden Scienceطراحی دارو یک فرآیند بسیار پیچیده، پرهزینه و زمان‌بر است اما با استفاده از نرم افزار های کامپیوتری ، بیوانفورماتیک و فارماکوژنومیک پشتیبانی زیادی را برای غلبه بر هزینه و شرایط زمان فراهم می‌کنند.بیوانفورماتیک توصیف‌ کننده طیف گسترده‌ای از پایگاه‌ های داده و نرم‌ افزارهای مرتبط با دارو است که می‌تواند برای اهداف مختلف، مربوط به طراحی و فرآیند توسعه دارو مورد استفاده قرار گیرد. همچنین، فارماکوژنومیکس اطلاعات سطح ژنوم را در مورد واکنش دارو متغیر فراهم می‌ کند، که برای شرکت‌ های داروسازی بسیار مهم است که داروهای جدید طراحی کنند اگرچه، بیوانفورماتیک و فارماکوژنومیک هنوز در مرحله اولیه خود هستند و در حال حاضر با موانعی مواجه هستند که به اندازه کافی پتانسیل لازم برای کمک به روند توسعه دارو در آینده نزدیک را نشان می‌دهند و رشد چشمگیری خواهد داشت.کسب اطلاعات بیشتر درباره طراحی داروموسسه سارایموسسه سارایSat, 06 Nov 2021 23:26:11 +0330